Antiguo Calvario del retablo de la Parroquia del Iglesia de Santa María del Sagrario (Málaga).

A finales del siglo XVII se le encarga a Jerónimo Gómez de Hermosilla una imagen para presidir el Retablo Mayor de la Parroquia del Sagrario de la Catedral, siendo esta la de un crucificado, la cual permanecerá en dicho lugar hasta comienzos del siglo XX. Entre julio y septiembre de 1936, la Parroquia del Sagrario fue asaltada durante la segunda Quema de Iglesias y Conventos durante el inicio de la Guerra civil. La imagen pudo salvarse debido a la altura a la que se encontraba, siendo dañadas la pierna derecha y el pie izquierdo.

La profanada imagen del crucificado fue devotamente recogida por un grupo de caballeros mutilados acordando fundar una cofradía de carácter militar, penitencial y procesional. El 16 de febrero de 1939, a iniciativa de Fernando Roldán Andreu, se erigió la Hermandad bajo el título de "Cofradía del Santísimo Cristo Mutilado", teniendo por titular al mencionado Cristo. Ese mismo año se efectúa la primera salida procesional en la noche del Jueves Santo. La Hermandad también entra en la Agrupación de Cofradías de Semana Santa de Málaga en 1939.

En 1940 se estrena el trono, diseñado por Adrián Risueño y ejecutado por el tallista Andrés Cabello Requena, el cual procesiona hasta 1975. Desde su creación hasta la década de los 70, la Hermandad experimenta un auge continuo, llegando a superar los 15000 hermanos. La imagen del Cristo Mutilado fue protagonista del cartel de la Semana Santa de Málaga en los años 1953, 1968 y 1976. El Jueves Santo del año 1976 la imagen procesionó por última vez en una andas provisionales de madera de caoba con dos grandes faroles de forja.

Desde febrero de 1992 hasta marzo de 1995, debido a la realización de obras en la Iglesia del Sagrario, el Santísimo Cristo Mutilado es trasladado a la Iglesia de los Santos Mártires. Durante estos tres años, la Hermandad realiza un Via Crucis por la feligresía de la Parroquia. Tras su regreso a la Catedral el Via Crucis pasó a realizarse por la feligresía de la misma, y al entrar los años 2000 por las naves catedralicias, primero el Jueves Santo y luego el Viernes Santo.

En marzo de 2016 se incorpora a la Cofradía una Titular Mariana, la Imagen de María Santísima bajo la advocación de Santa María Madre de la Divina Providencia. El Cristo Mutilado fue retirado del culto en junio de ese mismo año para ser sometido a un proceso de restauración por parte del profesor Juan Manuel Miñarro López, en Sevilla, mediante la cual se recobraría su aspecto original. La restauración consistió en una limpieza, consolidación y reintegración de la policromía y la restitución de las extremidades mediante un escaneo 3D. También se solventaron los problemas de estructura internos que padecía la imagen.

En 2020 la Virgen de la Divina Providencia es trasladada al convento de las Hermanas de la Cruz por el cierre de la Iglesia del Sagrario por restauración. A finales de septiembre de ese mismo año se aprueba en cabildo la nueva advocación del Cristo Mutilado, siendo esta la de "Clemencia". El 4 de octubre de 2020 se presenta en la Santa Iglesia Catedral la imagen del Santísimo Cristo de la Clemencia tras su proceso de restauración.

La tarde-noche Sábado de Pasión de 2022, la Hermandad en Cofradía realizó su primera Estación de Penitencia a la Santa Iglesia Catedral, acompañando al Cristo de la Clemencia la Banda de Cornetas y Tambores del Paso y la Esperanza.

Iconografía: Cristo muerto en la Cruz.

Cristo Crucificado muerto de finales del siglo XVII, del escultor malagueño barroco Jerónimo Gómez de Hermosilla, restaurado por Juan Manuel Miñarro López de 2019 a 2020. Presenta una rica policromía, con una tez pálida, matizada con tonos amoratados, y con profusión de regueros de sangre.

Iconografía: Virgen Dolorosa.

Dolorosa de candelero anónima de finales del siglo XVII, atribuida con fundamento al escultor barroco malagueño Antonio del Castillo, restaurada por Enrique Gutiérrez Carrasquilla. La imagen es de manos entrelazadas y de una policromía anacarada propia de la época.

Banda de Música:

• Credo del Mutilado, Perfecto Artola Prats (1962)
• Virgen de la Divina Providencia, Miguel Pérez Díaz (2019)
• Cristo de la Clemencia, Miguel Pérez Díaz (2020)

Música sacra

• Via Crucis, Arturo Díez Boscovich

En 2022 la Hermandad realizó por primera vez en la historia Estación de Penitencia a la Catedral.

Su sede canónica es la Iglesia Capitular del Sagrario de la Catedral, pero por motivos de restauración actualmente se encuentra establecida en la Santa Iglesia Catedral Basílica de la Encarnación.