Copa de la CEI 1999

A partir de esta edición, todos los participantes han sido divididos en dos divisiones. Ocho de ellos son de los equipos de los países que llegaron a la ronda de los cuartos de final de la edición anterior y que son incluidos en la división superior, mientras que los otros siete son incluidos en la primera división. Este formato es el que se aplica en las siguientes tres ediciones del torneo (1999–2001), aunque más tarde el formato cambió a su estado anterior (de 1996 a 1998). El cambion se implementó para reducir la cantidad de partidos poco competitivos entre oponentes con diferencia de nivel muy grande, como pasó en el partido entre Spartak Moscú de Rusia con el Vakhsh Qurghonteppa de Tayikistán, el cual terminó con victoria para el equipo ruso con marcador de 19–0.[1]

• División Superior: En la primera ronda los ocho equipos fueron separados en dos grupos (A y B). Los países representados que terminen en último lugar de cada grupo descienden a la primera división para el siguiente torneo. Los dos primeros lugares de cada grupo avanzan a las semifinales, incluyendo el resultado que tuvieron los equipos del mismo grupo en la fase previa. En las semifinales, los equipos enfrentarán a los equipos que clasificaron del otro grupo. Los dos mejores equipos de las semifinales juegan la final.
• Primera División: Siete países serán divididos en dos grupos (C y D). Un participante no oficial Rusia Sub-21 estará en uno de los grupos, pero sus resultados no cuentan para las posiciones finales. Las naciones representadas que ganen cada grupo ascienden a la división superior para el siguiente torneo.

1. El FBK Kaunas reemplaza al Žalgiris Vilnius (líder la la liga tras la pausa invernal), que abandonó el torneo aduciendo que la mayoría de sus jugadores eran juveniles que participaban con las selecciones menores de Lituania en esos días.
2. Dinamo Tbilisi está representado por un equipo de jugadores juveniles.
3. Tulevik Viljandi participa como el equipo filial del Flora Tallinn, campeón de la Meistriliiga 1998.
4. Spartak-2 Moscú reemplaza al Pakhtakor Tashkent, campeón de la 1998 Uzbek champions, que abandonó el torneo junto a los demás equipos de Uzbekistán.

• 1999 CIS Cup at rsssf.com
• 1999 CIS Cup at football.by
• 1999 CIS Cup at kick-off.by